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Museu da Farmácia possui uma colecção que abrange 500 milhões de anos de história universal da saúde e da doença. O espólio reúne objetos de raro valor histórico, artístico, antropológico e científico oriundo de civilizações e culturas tão distantes no tempo e no espaço como a Mesopotâmia, o Egipto, a Grécia, Roma, os Incas, os Astecas, o Islão, a África, o Tibete, a China, o Japão entre outras.